据南府函[2014]121号“关于南充市2012-2013年度科技成果等级认定的通报”，我院大豆所“耐荫高蛋白套作大豆种质发掘与育种应用” 、油菜所“突破性杂交油菜新品种南油12选育与应用”分别荣获一等奖、三等奖。此次获奖成果共18项。
   “耐荫高蛋白套作大豆种质发掘与育种应用”成果，首次建立了“五位一体”套作大豆育种技术体系，创制出强耐荫套作大豆种质20份；培育出耐荫套作大豆新品种9个，其中“南豆12”“南豆16”为突破性品种，“南豆12” 在我国南方地区年推广面积达700万亩，占四川、重庆大豆播种面积的50%以上，已连续6年被农业部确定为我国南方地区主导品种。
   “突破性杂交油菜新品种南油12选育与应用” 成果，创造性地提出了油菜多果多粒育种方法并成功应用。育成的油菜新品种“南油12”实现了高产、优质、多抗、广适的有机统一，其芥酸、硫苷含量为迄今国家审定品种中最低；先后通过四川、国家长江上游和长江下游审定，获得植物新品种权；连续多年被评选为部、省主导品种，还被遴选为全国冬油菜（长江上游）区域试验和重庆市油菜区域试验对照种；“南油12”累计推广1292.90万亩，总增优质油菜籽16100.16万公斤，新增纯收益9.01亿元。